56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1107 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  100 
 
 		 314 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.29 
 
 		 320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  60.38 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  59.8 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.59 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  59.22 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  58.96 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.37 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.37 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  57.98 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  59.49 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.05 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.05 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  58.65 
 
 		 322 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.03 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.61 
 
 		 314 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.35 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  57.84 
 
 		 320 aa  363  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.61 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.95 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.29 
 
 		 316 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.4 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.25 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  53.7 
 
 		 313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.73 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  52.44 
 
 		 311 aa  331  8e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.51 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.52 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  48.42 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  49.48 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  48.73 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  46.82 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  46.82 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.88 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  49.2 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.17 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.17 
 
 		 326 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.56 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  50.52 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  50.52 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  38.63 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  38.99 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  37.36 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  38.27 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  32.74 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  24.57 
 
 		 584 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  22.46 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  33.03 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  28.21 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  26.1 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  32.82 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  27.83 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.83 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  26.73 
 
 		 428 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  25.19 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>