More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0721 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 
292 aa  590  1e-168  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  85.27 
 
 
292 aa  526  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  81.51 
 
 
292 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  78.42 
 
 
292 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  49.83 
 
 
293 aa  309  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  42.5 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  41.5 
 
 
296 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  40.8 
 
 
299 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  39.66 
 
 
295 aa  224  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  39.64 
 
 
299 aa  218  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  39.93 
 
 
299 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  34.21 
 
 
300 aa  175  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  37.19 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.34 
 
 
329 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.83 
 
 
292 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  35.9 
 
 
292 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.9 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  30.1 
 
 
292 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.44 
 
 
271 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.24 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  36.13 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.73 
 
 
282 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.75 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.64 
 
 
324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.79 
 
 
283 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  34.18 
 
 
340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.41 
 
 
288 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.7 
 
 
282 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.55 
 
 
283 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.1 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.75 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  30.14 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.62 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.64 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.79 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.99 
 
 
301 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.96 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.36 
 
 
287 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.96 
 
 
302 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.5 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.26 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.76 
 
 
301 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.68 
 
 
296 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 
266 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.26 
 
 
456 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.67 
 
 
314 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.93 
 
 
280 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  30.84 
 
 
265 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.98 
 
 
299 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.78 
 
 
301 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 
301 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.77 
 
 
301 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.25 
 
 
285 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  35.64 
 
 
264 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  27.3 
 
 
302 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  27.3 
 
 
302 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  26.98 
 
 
301 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  33.88 
 
 
332 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  30.8 
 
 
292 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.55 
 
 
281 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  29.96 
 
 
265 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.14 
 
 
301 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25.9 
 
 
459 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.91 
 
 
306 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.91 
 
 
281 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  28.42 
 
 
301 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  32.94 
 
 
299 aa  102  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  32.96 
 
 
262 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  29.2 
 
 
301 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.02 
 
 
294 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.8 
 
 
300 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  28.42 
 
 
301 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  26.76 
 
 
301 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.78 
 
 
300 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.94 
 
 
301 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  30.2 
 
 
303 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.42 
 
 
301 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  27.65 
 
 
301 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  28.42 
 
 
301 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  30.61 
 
 
303 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.75 
 
 
282 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.97 
 
 
300 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  28.26 
 
 
302 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  28.47 
 
 
301 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  28.06 
 
 
301 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  26.76 
 
 
301 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 
301 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 
301 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  28.06 
 
 
301 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.36 
 
 
411 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.25 
 
 
267 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.06 
 
 
301 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.15 
 
 
299 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  28.12 
 
 
301 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.18 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.08 
 
 
344 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  31.42 
 
 
298 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.38 
 
 
264 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  27.81 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.13 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>