More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2545 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 
289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  63.86 
 
 
288 aa  363  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  61.32 
 
 
290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  59.86 
 
 
291 aa  320  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  56.42 
 
 
299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.09 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.71 
 
 
313 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  35.24 
 
 
313 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.5 
 
 
292 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.71 
 
 
313 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  31.1 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 
459 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  31.1 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.46 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
456 aa  89  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  30.35 
 
 
292 aa  89  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.34 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.1 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  27.94 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 
336 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 
336 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.84 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  32.49 
 
 
338 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.05 
 
 
301 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  26.92 
 
 
458 aa  85.9  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  31.19 
 
 
328 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.58 
 
 
301 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  31.19 
 
 
328 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  30.62 
 
 
300 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  31.5 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.35 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.35 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.34 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.99 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  29.58 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  29.68 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  30.69 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  31.98 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  31.5 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.95 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  29.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  33.01 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.73 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.37 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  29.61 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  33.65 
 
 
324 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  27.86 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  28.85 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.88 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.39 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.28 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.92 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  30.28 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.88 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  28.02 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  28.71 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.7 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.83 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  32.23 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.88 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.88 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.88 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.4 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  27.75 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  26.6 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.29 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  29.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  29.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.16 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  29.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  28.97 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  29.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.08 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  29.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.33 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.63 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.13 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.09 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.23 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  31.65 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.34 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  26.34 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.64 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>