More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1105 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  100 
 
 		 262 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  60.98 
 
 		 267 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  59.39 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  58.66 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  39.27 
 
 		 292 aa  121  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  34.31 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.19 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.02 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  30.81 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.52 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.92 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.92 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  35.48 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.48 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.92 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  32.96 
 
 		 292 aa  102  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.36 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.6 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  36.41 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.01 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.08 
 
 		 344 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.73 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  31.11 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.32 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.15 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  30.23 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.06 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  33.67 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.83 
 
 		 296 aa  96.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.59 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  35.02 
 
 		 332 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.65 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.48 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  34.55 
 
 		 317 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  35.65 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.84 
 
 		 329 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.7 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.69 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.8 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.12 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.61 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.85 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  31.89 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  34.45 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.83 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.2 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.77 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.17 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.55 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  29.44 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.74 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.37 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.65 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.78 
 
 		 299 aa  85.1  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.63 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  28.97 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.8 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.69 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  27.83 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.48 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  28.98 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  28.34 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  28.34 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  28.34 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.17 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.12 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.34 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.61 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  28.34 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.15 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.61 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  30.61 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.44 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  30.89 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  28.98 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.34 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.54 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.19 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  29.35 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.03 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  28.05 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  28.34 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  28.86 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  29.08 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  28.34 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  27.88 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  28.8 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.08 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.89 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  31.34 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.61 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.16 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>