More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2369 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 
299 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  63.88 
 
 
288 aa  364  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  63.3 
 
 
290 aa  360  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  61.46 
 
 
291 aa  345  8e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  56.42 
 
 
289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  29.2 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.45 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  30.88 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.44 
 
 
262 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.74 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  35.53 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.77 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.37 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.35 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  29.59 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.77 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  28.24 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.72 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.59 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  30 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.16 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2282  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1581  S6 modification enzyme RimK  32.14 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.683283  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  28.31 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  29.29 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.7 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  29.55 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.69 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.85 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.15 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.15 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.85 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.4 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29.85 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  30.53 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29.85 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.85 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.25 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.52 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2370  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  30.77 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  28 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  29.09 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  29.23 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.93 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  30.96 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.16 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.26 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.91 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  34.52 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.37 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  27.84 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  29.23 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.17 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 
331 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  33.16 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.74 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.33 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  28.86 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  29.23 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  28.79 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.2 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  35.82 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  28.64 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.14 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  28.86 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.57 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  28.31 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.09 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  28.31 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.05 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.93 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  27 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.66 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.95 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  31.19 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  28.44 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  30.46 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  30.93 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  27.15 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.96 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.73 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  26.44 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>