More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3306 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 287 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  71.83 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  70.03 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  69.69 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  60.98 
 
 		 282 aa  351  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  55.71 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.84 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.48 
 
 		 281 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  48.61 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.75 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.36 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  42.86 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.18 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.71 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.78 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.68 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.6 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.76 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.88 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.39 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.86 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.36 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.96 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  39.37 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.77 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.17 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  40.39 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  34.17 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  29.06 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.82 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  33.65 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  32.27 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  32.7 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.63 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  31.1 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.53 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  38.36 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  29.71 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.18 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  33.77 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  28.62 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  34.1 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.55 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.96 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  26.96 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.18 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  31.8 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  26.96 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.09 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  36.45 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  36.45 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  36.45 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  36.45 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  36.45 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.21 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.91 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  33.95 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  33.95 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  30.71 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  35.47 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.96 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.74 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.21 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  25.96 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.5 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  29.19 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.36 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  34.2 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  26.82 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  33.5 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  33.99 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  34.2 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  29.21 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  31.09 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  27.95 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.18 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.87 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  28.42 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.17 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.2 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  32.09 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  31.55 
 
 		 262 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.64 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  32.09 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.18 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.09 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  32.09 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.16 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.92 
 
 		 456 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.16 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.41 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>