More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1070 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  90.33 
 
 		 269 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  87.36 
 
 		 269 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  66.05 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  53.41 
 
 		 265 aa  254  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.57 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.29 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.92 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.31 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.21 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.96 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.43 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.37 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.67 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.89 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.85 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.95 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.47 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.95 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 338 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.63 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 331 aa  89.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.47 
 
 		 330 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.23 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.19 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  29.48 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  28.19 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.97 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.44 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.24 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  29.44 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.79 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  27.69 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.82 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.48 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  28.86 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.8 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  30.37 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.85 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  26.75 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.42 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  28.21 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  33.13 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.14 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.26 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  26.19 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.63 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.98 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  24.5 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25.63 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.51 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  26.44 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  22.17 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  27.61 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  26.2 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  24.91 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  27.69 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  26.17 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  27.21 
 
 		 285 aa  72  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  25.26 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  26.17 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  26.1 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.66 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.05 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  25.23 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.66 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  26.67 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.34 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  34.31 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.16 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  25.18 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.75 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  24.35 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  25.76 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.55 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.61 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.23 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  23.53 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  23.53 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.3 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.43 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  24.6 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  22.71 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25.22 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  30.38 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  30.38 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.67 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.86 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.15 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>