More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2364 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 267 aa  553  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  58.66 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  58.4 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  53.76 
 
 		 267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  35.32 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  32.23 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  31.78 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.41 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.31 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.78 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.87 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.95 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  34.03 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.68 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  34.72 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.45 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  36.45 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  38.05 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.44 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  31.31 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  33.93 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.37 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.25 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.96 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.54 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  27.31 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  37.93 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.82 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  36.95 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.2 
 
 		 306 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.33 
 
 		 295 aa  95.5  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  31.84 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  33.8 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.98 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.08 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.01 
 
 		 317 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.61 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.94 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.83 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  30.69 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.69 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.68 
 
 		 309 aa  92.4  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.69 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.69 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.9 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.74 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.06 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  34.25 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.99 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  26.27 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.29 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 331 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 338 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.2 
 
 		 330 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.17 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  34.74 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  35 
 
 		 340 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  33.18 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.28 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  29.86 
 
 		 456 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 459 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.16 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  32.23 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  33.18 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  37.63 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.49 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  38.12 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.95 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  32.38 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.32 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  33.68 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.83 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  32.38 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.93 
 
 		 329 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.23 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.42 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  32.43 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.62 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  27.11 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  34.38 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.31 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  30.81 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  30.81 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.33 
 
 		 296 aa  85.1  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.06 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  31.43 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  31.43 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  31.43 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  31.43 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  32.23 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>