264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0874 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  100 
 
 		 292 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  95.89 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  96.23 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  84.14 
 
 		 292 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  54.98 
 
 		 293 aa  359  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  33.68 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.35 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  34.58 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  35.9 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  29.53 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.44 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.44 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.95 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.31 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.51 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  29.55 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.45 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  28.28 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.28 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.05 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  31.87 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  29.57 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.82 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.28 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.36 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.19 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.92 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  29.93 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.52 
 
 		 344 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  27.52 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.49 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.79 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.8 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.03 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.67 
 
 		 314 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.13 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.85 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.55 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  28.05 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  29.14 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  27.64 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.33 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  31.92 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  27.68 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.17 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.43 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.37 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  36.24 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.92 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.07 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.31 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.87 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.87 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.32 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.87 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.33 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.08 
 
 		 471 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.88 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  29.26 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.8 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.67 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.31 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.91 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.7 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.7 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.81 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.8 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  29.7 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  29.09 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  29.09 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  28.99 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.72 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  28.73 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.49 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.73 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  27.56 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  28.36 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.34 
 
 		 301 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.53 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.93 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  32.45 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  30.22 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  35.1 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.27 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.97 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.41 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>