More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1137 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  64.31 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.88 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.55 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.75 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.75 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.13 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.46 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.64 
 
 		 282 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.23 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.88 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.24 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.88 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.51 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.5 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.46 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.8 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.75 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.65 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.96 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.77 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.8 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.1 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.96 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  33.22 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  31.82 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  31.45 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  31.56 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  39.22 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  32.95 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  35.48 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.58 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  33.76 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  34.1 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.41 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  32.08 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  32.64 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.34 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.6 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.6 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.13 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  29.91 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.84 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.8 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.7 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.68 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.66 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  31.63 
 
 		 269 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  27.52 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.52 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 338 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.66 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.28 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.12 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  30.23 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  29.88 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.58 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.19 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.8 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.23 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  29.34 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  30.92 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  28.37 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  30.12 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.17 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  31.82 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.81 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  28.77 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  26.12 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.7 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.05 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  26.19 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.87 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  24.65 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  29.8 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.4 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25.9 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.31 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>