More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0328 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 294 aa  597  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  90.78 
 
 		 296 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  79.44 
 
 		 291 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  72.31 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.26 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.57 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.77 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  45.74 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.91 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.72 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.36 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.86 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.61 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.35 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.3 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.49 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.3 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.32 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.5 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.97 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.66 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.67 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.79 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.19 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.6 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.31 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.78 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  31.46 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  30.16 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.48 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.05 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  27.61 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.92 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.43 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.46 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  31.65 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  28.03 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.13 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  34.02 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  27.47 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.38 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  34.38 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.36 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  28.72 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  28.68 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.62 
 
 		 269 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.22 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  30.56 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  30.24 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  27.47 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.94 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.08 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.84 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.08 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  33.49 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.24 
 
 		 447 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  26.06 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.18 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  27.68 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.77 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.97 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.12 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  29.19 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  28.32 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  26.22 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.28 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.74 
 
 		 447 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.83 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  25.83 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  27.43 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  28.16 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  33.5 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 456 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  26.57 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  25.76 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.51 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.61 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.01 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.87 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.12 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.94 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.64 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25.61 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  27.81 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  25.95 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  27.03 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  25.95 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  26.89 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.77 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.77 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.77 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  25.77 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.05 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>