More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1298 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 271 aa  536  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  58.97 
 
 		 302 aa  295  4e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  58.76 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  56.39 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  57.72 
 
 		 267 aa  281  5.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.83 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  38.72 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  39 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.18 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.65 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  40.38 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.61 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.3 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.21 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.17 
 
 		 287 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.01 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.93 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.21 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  39.48 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  35.51 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.42 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  34.2 
 
 		 266 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.37 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  34.44 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.31 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  37.23 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  34.06 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.38 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.26 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.82 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.09 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.21 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  42.57 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  36.56 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.34 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.88 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.23 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.5 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.71 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  33.65 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  33.65 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  32.16 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  32 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  35.51 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  33.66 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  34 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.53 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  33.49 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  33.49 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.33 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  36.76 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.04 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  32.7 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  32.87 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  32.87 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.18 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.06 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.01 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.01 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  33.65 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  33.65 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  33.65 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  33.65 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  33.65 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  35.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.54 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.17 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  30.23 
 
 		 459 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  29.77 
 
 		 456 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  32.71 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  33.5 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  33.18 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.02 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  32.68 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.07 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  33.98 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.75 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  33.01 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.02 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  32.69 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.07 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  31.88 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.1 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  34.3 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  31.72 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>