258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0772 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 312 aa  633    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  76.64 
 
 		 291 aa  474  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.94 
 
 		 294 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.31 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  70.92 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.2 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  40 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.87 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.67 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.04 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.39 
 
 		 281 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.78 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.38 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.38 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.46 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.23 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.55 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.44 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.1 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.54 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.9 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.76 
 
 		 283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.78 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.3 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.53 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.53 
 
 		 271 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.94 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.91 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  29.96 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.24 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  29.54 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  30.77 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.43 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  29.26 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  28.46 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  31.19 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  27.91 
 
 		 265 aa  85.9  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  27.91 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  31.98 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.98 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  27.36 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  28.02 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  28.82 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.56 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  23.17 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.62 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.09 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  29.04 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  26.29 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  31.85 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.98 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  32.65 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.5 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  26.03 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.53 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  24.91 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  23.87 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.14 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.51 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  29.34 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  31.58 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.88 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.64 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  24.76 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  29.41 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.33 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  30.12 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  23.87 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  24.69 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.34 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  23.87 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  24.67 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  23.18 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.34 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  22.88 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  26.21 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  24.07 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  28.19 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  24.21 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.65 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  23.73 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  28.3 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  22.53 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.6 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  24.46 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  22.19 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  22.27 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.08 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  26.32 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  25.43 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  28.92 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  22.01 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.3 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  26.42 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>