225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1768 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  53.92 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  54.3 
 
 		 311 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2700  RimK domain protein ATP-grasp  49.83 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.734268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  47.95 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.22 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  27.62 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.91 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  29.02 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  28.26 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.63 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  26.15 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.12 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.91 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  27.98 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  25.62 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.03 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.26 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.18 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  23.59 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.1 
 
 		 293 aa  85.9  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.3 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.03 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  23.24 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.59 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.26 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.91 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  26.53 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  22.77 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.1 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.63 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  25.22 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  25.16 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.58 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.79 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.74 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.91 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.19 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.15 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.85 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.58 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  25.58 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  24.38 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.18 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.94 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.91 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.48 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  26.94 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.71 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.7 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.33 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.75 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  23.57 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.46 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.14 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.6 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  23.91 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.29 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.83 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.31 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.23 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.32 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.63 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  23.96 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.59 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.46 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  23.23 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  25.85 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.79 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.09 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.66 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  23.29 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.67 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  23.11 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  23.11 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  22.97 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.15 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.21 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.69 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.89 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.54 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  25.69 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.65 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  23.69 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>