More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1704 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  74.64 
 
 		 281 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.94 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.39 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.21 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.62 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.73 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.21 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.71 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.77 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.1 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.45 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.52 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.71 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.69 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.87 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.5 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.91 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.68 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.6 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.33 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.37 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  32.49 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.3 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.99 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  29.27 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  34.31 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  30.69 
 
 		 266 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.14 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  30.74 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  32.8 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  31.88 
 
 		 459 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 		 292 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  31 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  32.74 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  32.73 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.64 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  30.17 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.74 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.68 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.66 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 		 458 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.55 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  31.84 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.09 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  29.46 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  28.05 
 
 		 300 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.34 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  34.12 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  30.04 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  30.04 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  31.39 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  31.39 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  30.08 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.83 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.04 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.8 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.04 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  30.04 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.7 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  30.74 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.83 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 328 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.28 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  30.61 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.81 
 
 		 301 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  28.38 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  28.38 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  28.38 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  31.14 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  29.05 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  27.8 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  30.56 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.88 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.05 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.51 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.38 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  30.23 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  32.13 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  28.81 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  30.22 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>