More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1175 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  72.98 
 
 		 285 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  73.68 
 
 		 285 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  73.33 
 
 		 285 aa  454  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  64.44 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  34.03 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 338 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 336 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.61 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  33.61 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.93 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.41 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.92 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  33.03 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.52 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  30.49 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.99 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.41 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.74 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  30.7 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.99 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.52 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  26.94 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.77 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  28.7 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.13 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  27.4 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  32.39 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.86 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  26.8 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  29.78 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  26.38 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  27.3 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  27.3 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.7 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  26.8 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.47 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  30.09 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.68 
 
 		 411 aa  87  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.6 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.77 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  26.72 
 
 		 300 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.12 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.1 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  27.13 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.48 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  28 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.4 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.34 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  27.32 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.09 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  26.72 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  26.12 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.64 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.74 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  29.65 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  27.32 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  29.96 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  27.31 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.6 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.51 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  28.11 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  29.66 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.2 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  26.46 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  27.73 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  27.73 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.41 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  27.75 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2232  alpha-L-glutamate ligase  26.14 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109123  hitchhiker  0.00523589 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  28.16 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  25.89 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  25.09 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.34 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.58 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.5 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.82 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.91 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  27.12 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  27.12 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>