More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1991 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  74.64 
 
 		 282 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.33 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.07 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.51 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.78 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.86 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 281 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.34 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.02 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.45 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.63 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.8 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.57 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.97 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.56 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.14 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.08 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.26 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.32 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.03 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.51 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.54 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.15 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  32.97 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.38 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  32.51 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  31.07 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.82 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  31.88 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.02 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  30.4 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.76 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.13 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  29.05 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  31.06 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  31.12 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  31.1 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.22 
 
 		 300 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.02 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  30.71 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.25 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  28.52 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  29.66 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.52 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.49 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.11 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.32 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.32 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  29.28 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.43 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  29.66 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  29.28 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  29.28 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  29.28 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  28.52 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.01 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.92 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.24 
 
 		 459 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 456 aa  93.2  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.99 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  30.29 
 
 		 301 aa  92.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.5 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  27.35 
 
 		 458 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  28.09 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  30.08 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  28.63 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  30.49 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  28.57 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  28.63 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  30.36 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  28.95 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.91 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  29.79 
 
 		 301 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  32.35 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  30.56 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  25.56 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  25.56 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  25.56 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30.64 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  29.49 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.14 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.11 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  25.11 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  29.86 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  29.92 
 
 		 301 aa  90.1  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  25.11 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  25.11 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  29.22 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  29.39 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>