More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1288 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.93 
 
 		 280 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  40.94 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  41.49 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.3 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.08 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.85 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.87 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.28 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.46 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.76 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.81 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.69 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.33 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.97 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.75 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.62 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.59 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.94 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.06 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.41 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.33 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.65 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.41 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.96 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.82 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  34.06 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  33.79 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  32.37 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.79 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  33.62 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  34.25 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  31.65 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.62 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  35.71 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  31.87 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  31.01 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  34.27 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.36 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.27 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.51 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  29.29 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.14 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  29.44 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.41 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.32 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.91 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  27.53 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.39 
 
 		 327 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.1 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.93 
 
 		 321 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.7 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.87 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  31.25 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  31.75 
 
 		 264 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.84 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.34 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  32.34 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.93 
 
 		 447 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  29.95 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.94 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.93 
 
 		 411 aa  86.7  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.9 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  27.33 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  30.99 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  27.94 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  26.24 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.28 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.76 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  31.8 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  30.42 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  30.42 
 
 		 336 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.69 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  30.37 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  27.11 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.54 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  30.42 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.64 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29.54 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29.54 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.54 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.04 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.98 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.34 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  24.5 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.58 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.28 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  25.55 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  25.55 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25.18 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.15 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.34 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.91 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>