More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0912 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 271 aa  544  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  66.42 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  66.05 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  66.67 
 
 		 269 aa  364  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  55.34 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.62 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.8 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.62 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.66 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.62 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  28.33 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.4 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.65 
 
 		 293 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.67 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.67 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.17 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.44 
 
 		 283 aa  95.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.05 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.69 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.05 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.08 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.75 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.31 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  27.35 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 294 aa  89.7  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  27 
 
 		 317 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.35 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.44 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.11 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  27.32 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  27.32 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  27.84 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  27.46 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  27.46 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.91 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  27.32 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.46 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.98 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  27.46 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.8 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  22.92 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  22.92 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  22.92 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  22.92 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  30.87 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  26.71 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  25.88 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  22.57 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  27.01 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  22.57 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.32 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.01 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.51 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.58 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  25.59 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.38 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.34 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  24.19 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  24.47 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  24.47 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.34 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.34 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.7 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.79 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  25.4 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  23.02 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.42 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.83 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.53 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  28.36 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  21.88 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  24.05 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  26.42 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  24.05 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  23.48 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.24 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25.7 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.14 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  23.74 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  22.49 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  25.96 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  24.34 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  24.34 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  26.64 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  21.53 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>