More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1379 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  77.9 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  78.28 
 
 		 283 aa  428  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.28 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  57.72 
 
 		 271 aa  281  5.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  39.27 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.73 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.64 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  40.15 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  41.7 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.49 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  39.48 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  40.36 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  42.32 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.96 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  43.75 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.67 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.27 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.41 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.62 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.47 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.87 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.76 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.79 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  40.39 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.13 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  35.32 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.4 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.96 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  36.24 
 
 		 292 aa  139  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  38.21 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.45 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.56 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  40.43 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  36.2 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.56 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  35.75 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  39.55 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.99 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  33.5 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.7 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  31.96 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  31.96 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  36 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.8 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  34.39 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.79 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  33.33 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.64 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  32.24 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  32.24 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.18 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.36 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  34.1 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  35.21 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  29.5 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.91 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  33.79 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  34.26 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  31.05 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  31.51 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  30.14 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  31.96 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  34.62 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  32.52 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  31.82 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.67 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  32.52 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  31.82 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  31.65 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 459 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.17 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  31.96 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.78 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  32.26 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  32.26 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  31.96 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.42 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  31.96 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.28 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  33.02 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.49 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  38.22 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  30.73 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  32.21 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  31.36 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.22 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>