292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1580 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 
292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  83.79 
 
 
292 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  84.14 
 
 
292 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  83.45 
 
 
292 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  55.59 
 
 
293 aa  361  9e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  33.56 
 
 
292 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.58 
 
 
329 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.78 
 
 
310 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.76 
 
 
292 aa  145  6e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.55 
 
 
295 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  29.29 
 
 
292 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  30.1 
 
 
292 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  32.47 
 
 
307 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.71 
 
 
296 aa  133  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.49 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.5 
 
 
282 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  35.62 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.92 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  30.13 
 
 
333 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.08 
 
 
306 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  34.89 
 
 
298 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.69 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.58 
 
 
344 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  30.41 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.06 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.19 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  28.18 
 
 
304 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.18 
 
 
304 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.27 
 
 
287 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.63 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.08 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.37 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.78 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  27.33 
 
 
302 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.11 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.84 
 
 
304 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.32 
 
 
281 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.71 
 
 
280 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  27.69 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.24 
 
 
308 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.1 
 
 
299 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  28.27 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.18 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.76 
 
 
314 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  30.81 
 
 
262 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  28.39 
 
 
332 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.28 
 
 
283 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 
293 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.52 
 
 
283 aa  106  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.67 
 
 
411 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.64 
 
 
311 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.74 
 
 
327 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.46 
 
 
294 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.46 
 
 
296 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.3 
 
 
327 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.3 
 
 
327 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 
340 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.69 
 
 
283 aa  102  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.13 
 
 
264 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.01 
 
 
271 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  29.92 
 
 
329 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.21 
 
 
267 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.17 
 
 
302 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  26.3 
 
 
305 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.42 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  30.04 
 
 
300 aa  99  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.67 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  33.03 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  32.65 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  32.65 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  28.18 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.76 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  32.65 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  28.88 
 
 
301 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.81 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.29 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.26 
 
 
300 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.03 
 
 
471 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  27.3 
 
 
301 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  29.29 
 
 
299 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.55 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  28.45 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  32.14 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.8 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.51 
 
 
302 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.19 
 
 
447 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.77 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  30.33 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  30.33 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  31.12 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.24 
 
 
301 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  31.12 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  31.12 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.12 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  25.75 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  28.08 
 
 
301 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>