270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1789 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.1 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  49.25 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  46.45 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  48.44 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  41.36 
 
 		 307 aa  214  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.89 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.52 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  45.58 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  47.16 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  47.16 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  44.22 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  44.01 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  45.7 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  47.16 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  45.02 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  44.08 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  34.89 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.12 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.09 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  29.93 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  34.48 
 
 		 292 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  33.62 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.19 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.27 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.39 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.05 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.03 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.58 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  34.45 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  30.93 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  31.86 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  30.74 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.78 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  33 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.36 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.81 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  33.78 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.07 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  33.18 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.57 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  27.98 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.24 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.29 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.67 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.62 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.58 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.67 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.66 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  29.58 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.97 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.55 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.65 
 
 		 283 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.41 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.18 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.71 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.97 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.44 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  29.51 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.45 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  32.89 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  40.38 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.52 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.62 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.64 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.39 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30.07 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.26 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.67 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.52 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  32.75 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.8 
 
 		 411 aa  92.8  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  36.23 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.76 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  29.21 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.03 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  28.33 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  28.33 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  28.33 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  30.19 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  30.21 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  29.17 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  28.37 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.87 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.87 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.24 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.67 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.87 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  28.03 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>