278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6485 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 333 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  78.78 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  69.16 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  68.08 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  62.23 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  64.44 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  52.3 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  49.67 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  47.87 
 
 		 307 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  46.11 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  46.93 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  46.93 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  46.6 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  45.9 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  46.45 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  46.23 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  46.2 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.18 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  30.07 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  30.13 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.55 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  29.74 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  37.06 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  28.01 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.28 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.71 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.64 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.05 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  30.72 
 
 		 292 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.81 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  33.47 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.48 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.75 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.85 
 
 		 301 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  34.17 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  30.93 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.99 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.37 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.84 
 
 		 283 aa  99.8  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  29.9 
 
 		 301 aa  99.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.05 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.91 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  28.48 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  27.69 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  33.67 
 
 		 262 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.49 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.89 
 
 		 299 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.97 
 
 		 292 aa  95.9  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2700  RimK domain protein ATP-grasp  25.64 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.734268  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  32.51 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.69 
 
 		 282 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  29.51 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.69 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.37 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  27.81 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  27.02 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.23 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.81 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  28.52 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  30.62 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  28.75 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  28.29 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.24 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  27.36 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.52 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  28.52 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  27.02 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  28.52 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  28.52 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.34 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.64 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  28.2 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  28.66 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  28.48 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  28.2 
 
 		 301 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.5 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.5 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.5 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.92 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  33.91 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  26.75 
 
 		 459 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.6 
 
 		 296 aa  89.7  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.73 
 
 		 456 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  26.52 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.47 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.17 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.41 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  28.66 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.51 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  28.95 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  28.57 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  27.94 
 
 		 302 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  36.94 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.11 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  28.57 
 
 		 301 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  29.25 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  29.25 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>