More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2113 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 
340 aa  663    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  72.78 
 
 
314 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  72.78 
 
 
314 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  71.84 
 
 
314 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  37.16 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  35.22 
 
 
292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.77 
 
 
329 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  34.18 
 
 
292 aa  143  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  34.18 
 
 
292 aa  142  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.01 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  37.38 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  33.05 
 
 
293 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 
292 aa  133  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.75 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.88 
 
 
296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  40 
 
 
299 aa  129  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  37.71 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  29.19 
 
 
292 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.1 
 
 
344 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.14 
 
 
292 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.52 
 
 
310 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.16 
 
 
317 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.07 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  33.56 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.41 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.86 
 
 
283 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  33.1 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.42 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.69 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  32.12 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.53 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.53 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.12 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.12 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.12 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.91 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  31.83 
 
 
301 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  31.05 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.05 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  31.05 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  37.2 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  32.38 
 
 
302 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  31.05 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.11 
 
 
282 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  31.97 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.96 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.65 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  25.62 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.96 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  29.04 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  29.04 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  33.22 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  34.93 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35 
 
 
267 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.6 
 
 
300 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30.27 
 
 
301 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  30.03 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  35.35 
 
 
300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.49 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  34.12 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.07 
 
 
282 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.22 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.09 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  28.71 
 
 
301 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  34.1 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  29.63 
 
 
301 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  30.95 
 
 
307 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  30.85 
 
 
301 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.77 
 
 
302 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.65 
 
 
327 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  29.25 
 
 
301 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  28.01 
 
 
293 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.55 
 
 
308 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.27 
 
 
301 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
301 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.64 
 
 
287 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  31.91 
 
 
301 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
301 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  29.07 
 
 
301 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  31.33 
 
 
303 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  29.41 
 
 
301 aa  106  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  31.31 
 
 
303 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
301 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
301 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.81 
 
 
301 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  28.81 
 
 
301 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  27.24 
 
 
292 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.2 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.94 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  30.85 
 
 
301 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  29.38 
 
 
301 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 
329 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  29.38 
 
 
301 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.36 
 
 
304 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  31.75 
 
 
286 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  29.83 
 
 
301 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  29.83 
 
 
301 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  29.93 
 
 
300 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>