249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2864 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  53.74 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  52.3 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  50.17 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  50 
 
 		 317 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50.7 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  50 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  50 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  45.02 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.87 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  43.87 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  44.71 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.69 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  45.55 
 
 		 305 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  44.07 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  43 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  44.01 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.02 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.85 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  32.24 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  32.4 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.85 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.99 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.2 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.29 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.61 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  26.77 
 
 		 293 aa  99  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.18 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.8 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.84 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.69 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.04 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.29 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.82 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  32.21 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.33 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.3 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.17 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  32.86 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.21 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.73 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.98 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  32.65 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.5 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.5 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.84 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.99 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.58 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  30.58 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.55 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.5 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  31.94 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  31.94 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  31.94 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.94 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  35.44 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  30.17 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.37 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.69 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  31.02 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.78 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  27.1 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.84 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.87 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  27.12 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.76 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  27.07 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.97 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.62 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.53 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  28.17 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.53 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.68 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.73 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  34.18 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.39 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  26.39 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  26.39 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  26.39 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  26.17 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  25.64 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.2 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.6 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  25.08 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.08 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  27.87 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.08 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.08 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  27.47 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>