More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0151 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  49.83 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  48.46 
 
 		 292 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  47.77 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  48.47 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  41.69 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  43.39 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.16 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  38.52 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  37.81 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  42.39 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  38.18 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  34.08 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  35.62 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.27 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.56 
 
 		 329 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  33.47 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  34.05 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  33.05 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.48 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.87 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  33.74 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.39 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.48 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.45 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.02 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.05 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  37.16 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  28.08 
 
 		 458 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.71 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.42 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.18 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  28.83 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.38 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  30.32 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.4 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.78 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.83 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.96 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  29.18 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  29.18 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.8 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.93 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.94 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  28.77 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  30.93 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  30.94 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  27.76 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  30.22 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.62 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.81 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  26.76 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.6 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  27.37 
 
 		 301 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  27.76 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  27.76 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.76 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  27.76 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  28.07 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.76 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.76 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.14 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.76 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.64 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  27.76 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  30.23 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.92 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.3 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  30.49 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.61 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.28 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  30.49 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  25.96 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.04 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  27.4 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.04 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  28.31 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.48 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  29.6 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  29.6 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.47 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.44 
 
 		 411 aa  95.9  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  31.49 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  30.14 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  30.14 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  26.8 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  29.6 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.69 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  30.42 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.39 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  26.83 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  27.15 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  26.83 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  27.85 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>