More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1502 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  76.64 
 
 		 312 aa  474  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  79.44 
 
 		 294 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  78.4 
 
 		 296 aa  466  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.16 
 
 		 294 aa  443  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  45.42 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.76 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.21 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.5 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.86 
 
 		 287 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.37 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.17 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.43 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.49 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.67 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.01 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.06 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.97 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.96 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.04 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.68 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.45 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.45 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.32 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.94 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.5 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.55 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.28 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.17 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  31.23 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.48 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.58 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  27.21 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.8 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.39 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  30.74 
 
 		 265 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.03 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.86 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  33.86 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  28.5 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  29.55 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.56 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  27.08 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  28.44 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  26.55 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.21 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.62 
 
 		 447 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  32.75 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  29.47 
 
 		 333 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.78 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.09 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  29.58 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.08 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.74 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.34 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  28.76 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  29.17 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.29 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.34 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  33.5 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  33.7 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  29.86 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.85 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  26.91 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  31.88 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  27.45 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  26.99 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.14 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  26.2 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.01 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  24.33 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.25 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  28.11 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  31.84 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.92 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.52 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.68 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.77 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  25.45 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.67 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0286  RimK domain protein ATP-grasp  28.05 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  24.67 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.83 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.83 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.16 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.4 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  24.66 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.41 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  28.37 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  26.02 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.02 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  25.76 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  23.22 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.81 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>