More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0444 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.83 
 
 
281 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.46 
 
 
281 aa  244  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.69 
 
 
282 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.22 
 
 
283 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.28 
 
 
288 aa  222  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.68 
 
 
287 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.53 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.49 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.97 
 
 
292 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.05 
 
 
296 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.32 
 
 
294 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.16 
 
 
280 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.97 
 
 
291 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  34.91 
 
 
283 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.44 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.16 
 
 
282 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.47 
 
 
267 aa  155  7e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.96 
 
 
283 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.13 
 
 
283 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.06 
 
 
285 aa  152  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.73 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.15 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.71 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.99 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.21 
 
 
271 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  34.73 
 
 
264 aa  115  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  33.58 
 
 
265 aa  115  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  32.12 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.61 
 
 
264 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.69 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  30.53 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.95 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.9 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  32.08 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.83 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  33.33 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.56 
 
 
317 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.31 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  32.41 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  32.41 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  30.52 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.6 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  32.02 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.48 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.78 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  28.44 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  28.84 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.11 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.02 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.84 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.56 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  30.81 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  29.91 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  33.16 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.06 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  29.82 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  30.56 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  29.15 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  30.8 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.84 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.64 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  32.78 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  26.92 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  28.37 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  30.15 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  29.17 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  31.69 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.49 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  32.92 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.92 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.24 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  27.65 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  30.37 
 
 
301 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  30.37 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  26.89 
 
 
265 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.51 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.37 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  29.44 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  30.37 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.13 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  29.19 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  31.46 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.33 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.45 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.91 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.56 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.82 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  27.49 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.86 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  29.91 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  26.39 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  30.7 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>