251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2322 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1768  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase-like protein  53.92 
 
 		 302 aa  350  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  57.04 
 
 		 311 aa  348  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2700  RimK domain protein ATP-grasp  51.9 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.734268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  49.13 
 
 		 292 aa  295  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.19 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  27.18 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.39 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.53 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  26.82 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.97 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  27.73 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  24.83 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.52 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.12 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.71 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  25.09 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.57 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  23.78 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.14 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  23.78 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.65 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.31 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  24.89 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.98 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.55 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.28 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.14 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.03 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.72 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  25.71 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.49 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.7 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.77 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.9 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.28 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.61 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  24.19 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  24.19 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  24 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.89 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  26.7 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.91 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.23 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.57 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.82 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  26.57 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  25.87 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  24.77 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.18 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  25.26 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.33 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  22.4 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  23.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.83 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  27.38 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.46 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.83 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.53 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1298  RimK domain protein ATP-grasp  29.35 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.91 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  23.35 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  22.7 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.56 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  24.24 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.68 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  24.42 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  22.96 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.75 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  29.78 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  24.4 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.21 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.25 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.59 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  23.59 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.39 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.59 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.23 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.97 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>