195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1298 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1298  RimK domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 324 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2459  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.1 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  0.276307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  33.68 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.05 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.98 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.73 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  28.87 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  24.06 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  26.74 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  24.54 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  27.69 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  30.73 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.84 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.55 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  29.9 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  30.94 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.77 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.24 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  29.35 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  25.77 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  26.53 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.5 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.08 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.8 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  26.48 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.62 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  22.27 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  27.72 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.12 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.48 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0709  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  26.4 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.18 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.87 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  26.44 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  25.89 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.89 
 
 		 288 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.42 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0763  alpha-L-glutamate ligase  30.53 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.708688  normal  0.325873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.13 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  26.47 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  30.61 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  23.42 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  23.44 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.1 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  24.87 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  24.87 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.85 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.97 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.1 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  24.25 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.05 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  29.17 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  27.85 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.44 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.27 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  29.21 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  29.21 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.26 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  24.03 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25.97 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.53 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  27.72 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.01 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  25.14 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  25.89 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  24.62 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  27.72 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.72 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.65 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  24.46 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  23.86 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  27.72 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.37 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.46 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  24.46 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  24.12 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  24.46 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.3 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.84 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.12 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  26.4 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  24.77 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  24.12 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.92 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  25.91 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  24.12 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  24.12 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>