273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0780 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 285 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  97.19 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  92.63 
 
 		 285 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  73.33 
 
 		 285 aa  454  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  63.73 
 
 		 299 aa  384  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.83 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.83 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  29.83 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  29.83 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.18 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.46 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.22 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.46 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  28.84 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.52 
 
 		 411 aa  89  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  26.34 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.49 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  29.44 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.95 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  31.16 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.6 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.5 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  29.91 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  24.81 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  26.99 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  28.23 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.11 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.11 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  28.12 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  27.4 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.96 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.28 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.63 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.05 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  28.64 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.23 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.37 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.37 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  25.34 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.89 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.27 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  25.22 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.79 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  29.49 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.5 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  26.2 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  24.89 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.58 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.44 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.91 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.45 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.28 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  26.18 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  26.18 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  29.44 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.45 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  26.39 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.81 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.22 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  25.35 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.81 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.41 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  24.23 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  25.81 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.09 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  28.97 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  25.11 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.73 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  23.66 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.66 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  23.79 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.91 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  23.66 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.91 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.03 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  25.22 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  25.45 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>