More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1175 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  60.98 
 
 		 262 aa  329  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  59.4 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  53.76 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  38.43 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.43 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.94 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  32.94 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  37.7 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.34 
 
 		 321 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  33.18 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.2 
 
 		 311 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.66 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  33.51 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  31 
 
 		 317 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.7 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  34.54 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.82 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.96 
 
 		 306 aa  89  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.34 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  30.6 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  31.78 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.15 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.83 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.88 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  29.24 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  30.46 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  31.96 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  32.86 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.4 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.37 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  27.7 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.76 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.41 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.79 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.79 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.4 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.87 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.3 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.27 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.66 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  30.1 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.88 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.34 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  27.8 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.09 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  30.85 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  26.64 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  29.32 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.25 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.18 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  30.61 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  30.24 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.92 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.38 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.73 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.57 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  28.9 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.51 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.89 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  28.9 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.59 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.03 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  28.63 
 
 		 459 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  29.76 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  28.69 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  25.57 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  28.44 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  29.38 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.28 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.69 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.89 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.1 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.78 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0657  RimK domain protein ATP-grasp  29.95 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  28.29 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  27.97 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  27.64 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  28.88 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.67 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.54 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.54 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.54 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.34 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.94 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.96 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.47 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>