More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2616 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 294 aa  597  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  72.94 
 
 		 312 aa  457  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  72.16 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  73.7 
 
 		 296 aa  441  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  72.26 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.79 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.14 
 
 		 285 aa  262  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.79 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.75 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.01 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.4 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.9 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.68 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.14 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.28 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.91 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.08 
 
 		 293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.8 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.97 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.5 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.57 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.93 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.88 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.09 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.99 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.7 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  32.38 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  31.67 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  29.04 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.62 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  28.85 
 
 		 293 aa  99  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  28.93 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.34 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  35.68 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  26.32 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.68 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.57 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  29.67 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.31 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.44 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  28.52 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  30.88 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.8 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.2 
 
 		 447 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0531  alpha-L-glutamate ligase  35.09 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6005  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.76 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  28.23 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.87 
 
 		 447 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  27.31 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  32.47 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5781  alpha-L-glutamate ligase  35.04 
 
 		 305 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  28.37 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2864  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.84 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  30.42 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  30.7 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  26.3 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.67 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.25 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  24.34 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  32.38 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.75 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3149  alpha-L-glutamate ligase  28.88 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.3 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.13 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  28.96 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.47 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1657  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.6 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.161868  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  24.32 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2369  RimK domain protein ATP-grasp  32.37 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.438886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  28.52 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2434  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.43 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.19 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  33.19 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.98 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1175  hypothetical protein  31.37 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.521808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0157  RimK domain-containing protein ATP-grasp  23.2 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174298 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  25.68 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.66 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  28.07 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.92 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  29.49 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.39 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1505  alpha-L-glutamate ligase  28.4 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  27.01 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  22.94 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  25.52 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1170  alpha-L-glutamate ligase  28.4 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  normal  0.722984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.97 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.27 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.33 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  23.57 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1984  RimK domain protein ATP-grasp  26.82 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.976929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.25 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>