More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1151 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  63.6 
 
 		 281 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  62.59 
 
 		 281 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  56.23 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  51.94 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  53.17 
 
 		 285 aa  295  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  53.71 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  48.61 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.14 
 
 		 288 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  48.86 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.14 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.35 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.59 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  41.67 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.61 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.97 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.38 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.81 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.46 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.34 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  36.86 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.99 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.59 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.92 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.91 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.26 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  40.27 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  31.67 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.3 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.95 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  34.15 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  35.36 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.44 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.18 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  31.52 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.47 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  30.59 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.92 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  35.92 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  31.36 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  36.6 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  32.27 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  35.29 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32.25 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1789  alpha-L-glutamate ligase  38.57 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.186066  normal  0.64762 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  35.16 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  32.26 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.33 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.04 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  33.04 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  33.04 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.36 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  33.04 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.51 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.43 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.87 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  37.87 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  32.59 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  32.59 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.98 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  32.59 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  32.59 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  32.59 
 
 		 338 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.63 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.37 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  30.91 
 
 		 456 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  28.98 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  30.45 
 
 		 459 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  33.03 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.11 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.37 
 
 		 262 aa  89.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.29 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.68 
 
 		 267 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  32.38 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  32.88 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.8 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  34.08 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1175  alpha-L-glutamate ligase  28.89 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  36.11 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  33.63 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  36.11 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.81 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  35.43 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  34.39 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  33.63 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  31.94 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5945  alpha-L-glutamate ligase  36.99 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  34.09 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  33.63 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  33.63 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>