More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0847 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  87.36 
 
 		 269 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  85.13 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  66.67 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  56.2 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.55 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.96 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.76 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.44 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.74 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.24 
 
 		 296 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.32 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.09 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  34.12 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.24 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.85 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.71 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.27 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.63 
 
 		 309 aa  88.6  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.23 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  31.92 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.46 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.91 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.36 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.2 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.82 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.02 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.91 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.09 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  28.5 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  28.5 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  28.5 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  28.7 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.02 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  27.66 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  27.67 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.67 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.42 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  27.67 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.67 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  27.67 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  28.02 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.26 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.24 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  28.57 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  24.5 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  24.9 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  25.75 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  24.62 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  24.36 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  26.09 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  26.09 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  27.23 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.09 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.09 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1379  alpha-L-glutamate ligase  27.14 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  29.05 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2139  RimK domain protein ATP-grasp  28.21 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  24.07 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  24.07 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  24.29 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.96 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  25.42 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  25.73 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  27 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  24.48 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  29.38 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 458 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  25.08 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.95 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  23.93 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  23.93 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  23.3 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  23.93 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  23.93 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  30.56 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  27.09 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  28.78 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  25.42 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  26.32 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  21.81 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  22.07 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.79 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.66 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0780  alpha-L-glutamate ligase  26.59 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  25 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  25.71 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.6 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.6 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.6 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  23.59 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.54 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25.4 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  24.21 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>