More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0136 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0136  alpha-L-glutamate ligase  100 
 
 		 265 aa  519  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0877646  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  56.87 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  56.59 
 
 		 269 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  55.89 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  54.96 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  28.15 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.44 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  28.43 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.81 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  29.86 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  28.31 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.72 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.3 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.28 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.26 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.57 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.72 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  32.09 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0655  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.87 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.922088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.91 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  27.35 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  28.31 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  25.31 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.31 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.27 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  27.23 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.87 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  24.45 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  26.92 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.35 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.26 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  24.36 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  30.34 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.27 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.61 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.61 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.83 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.31 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  22.34 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.11 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  27.74 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.6 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.03 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.73 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.64 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.35 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.79 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.07 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  27.54 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  27.72 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.04 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.62 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.47 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  22.94 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.47 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.96 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.47 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  22.85 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.5 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.24 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.97 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  21.82 
 
 		 329 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.38 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2195  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0177868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2272  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2405  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0279362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  24.18 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1882  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000288725  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1834  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258771  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  26.92 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2443  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.61 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000377091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1848  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000133826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  22.71 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  27.75 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  26.61 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  22.99 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.81 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.07 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  22.26 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  22.71 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.65 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  23.99 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5981  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.46 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  27.66 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  26.16 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  21.27 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  24.68 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.8 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  23.64 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  24.68 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.38 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  26.03 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  25.96 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>