More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2724 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  90.68 
 
 		 281 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  63.6 
 
 		 292 aa  342  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  57.3 
 
 		 283 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  55.68 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.48 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  53.05 
 
 		 285 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.55 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  49.45 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.83 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.68 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.76 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.61 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  41.43 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.38 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.44 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.37 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.33 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.11 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.51 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.1 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  38.49 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  172  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.04 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  37.36 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.93 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  40.37 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  33.57 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  34.62 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  35.05 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  34.58 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.05 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.91 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.95 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  33.82 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  37.37 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  32.62 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  34.03 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  34.03 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.65 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.8 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  32.55 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  31.91 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.93 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  34.06 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0115  alpha-L-glutamate ligase  34.07 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.353458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.64 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  32.05 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.72 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.78 
 
 		 295 aa  99.4  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.02 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  31.51 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.51 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  33.33 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  30.25 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  28.24 
 
 		 456 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  32.26 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  30.63 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  30.56 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  32.72 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  31.09 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  31.09 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.09 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.9 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.9 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.88 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.48 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  31.09 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  31.34 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  31.09 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  27.31 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  31.34 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  33.8 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  31.1 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.26 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  31.07 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  37.08 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.43 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  30.25 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  37.7 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  30.25 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.02 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.02 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.02 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  30.25 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  32.57 
 
 		 329 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  30.25 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>