33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3069 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 330 aa  661    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  54.29 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  51.2 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  46.91 
 
 		 351 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  47.09 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  42.73 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  39.37 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  31.58 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  34.82 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  34.76 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  35.59 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  27.8 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  26.76 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  20.54 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  27.38 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  28.4 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  21.29 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  22.05 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  22.19 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  20.46 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  24.41 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  19.57 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  23.36 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  22.64 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  21.9 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.79 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  27.96 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.12 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  21.49 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  28.5 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  29.8 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>