32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1641 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  594  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  43.18 
 
 
307 aa  245  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  42.54 
 
 
319 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  35.58 
 
 
301 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  34.53 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  34.42 
 
 
295 aa  146  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  35.9 
 
 
295 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  33.88 
 
 
299 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  29.02 
 
 
311 aa  95.9  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  32.88 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  26.81 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  27.8 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  27.8 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  30.07 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  27.27 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  32.06 
 
 
360 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  34.27 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  29.08 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  26.63 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  25.57 
 
 
350 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  27.78 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.38 
 
 
357 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  25.42 
 
 
351 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  26.18 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  26.9 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  28.5 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  25.4 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  25.97 
 
 
346 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  27.47 
 
 
924 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>