221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2010 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 360 aa  731    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  57.54 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  56.82 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  52.66 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  49.16 
 
 		 366 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  36.15 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  34.63 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  36.32 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  33.05 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  24.85 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  22.54 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  30.73 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  21.92 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  27.02 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  24.72 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  30.3 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  25.41 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  21.64 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  20.79 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  29.52 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  26.95 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  32.06 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  30.12 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  25.8 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  25.63 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  26.92 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0849  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.39 
 
 		 1087 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.173852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  30.56 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  23.86 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0135  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.6 
 
 		 1025 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0153019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.22 
 
 		 1496 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.47 
 
 		 1080 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145258 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.28 
 
 		 1040 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3031  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.7 
 
 		 1084 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144026  decreased coverage  0.0049366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  26.47 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.73 
 
 		 1073 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1068 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1296  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.14 
 
 		 1031 aa  53.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0679  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.49 
 
 		 1095 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2728  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1077 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.523784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1184  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.7 
 
 		 1025 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.17 
 
 		 1071 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4501  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.49 
 
 		 1073 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.38 
 
 		 1073 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1251  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1067 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4191  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.49 
 
 		 1073 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.725714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1458  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.73 
 
 		 1083 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0879  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1070 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.9 
 
 		 1063 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2617  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.41 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.38 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2390  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.73 
 
 		 1053 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1521  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.96 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0767  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.97 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256868  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.29 
 
 		 1068 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.73 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.3 
 
 		 1073 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2034  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.44 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.34 
 
 		 1056 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3357  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.34 
 
 		 1112 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.88 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.44 
 
 		 1064 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.53 
 
 		 1059 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.7 
 
 		 1065 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.92 
 
 		 1066 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.97 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.37 
 
 		 1072 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  23.76 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0560  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.19 
 
 		 1079 aa  50.4  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3018  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.88 
 
 		 1074 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.84 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0103005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.88 
 
 		 1082 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.67 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1726  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.96 
 
 		 1081 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.746976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0976  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.83 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1350  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.62 
 
 		 1086 aa  50.1  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.501423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4931  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1052 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1018  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.69 
 
 		 1087 aa  49.7  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0144  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.58 
 
 		 1025 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0870  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.38 
 
 		 1087 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.24 
 
 		 1081 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0977  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.65 
 
 		 1072 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2838  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.88 
 
 		 1073 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144627  normal  0.047859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  28.98 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3403  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.85 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000056188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0996  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.32 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.846706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0699  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.38 
 
 		 1077 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133334  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3204  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.67 
 
 		 1042 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610402  normal  0.762296 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.64 
 
 		 1072 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.88 
 
 		 1072 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.48 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.74 
 
 		 1082 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.52 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.06 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>