264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2798 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  746    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  51.97 
 
 
357 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  49.16 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  52.1 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  46.65 
 
 
357 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  31.43 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  32.71 
 
 
290 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  29.37 
 
 
391 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  25.21 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  26.92 
 
 
425 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  25.21 
 
 
349 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  24.65 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  22.95 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  24.93 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  26.46 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.26 
 
 
1106 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  25.63 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  34.38 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  26.04 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  26.22 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  24.02 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  30.46 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  28.43 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.31 
 
 
1071 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  25.94 
 
 
295 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.02 
 
 
1064 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  28.24 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  27.05 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.96 
 
 
1059 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  30.07 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.1 
 
 
1059 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  22.97 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  25.71 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  26.83 
 
 
302 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  26.01 
 
 
402 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.97 
 
 
1056 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  24.48 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  25.58 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.01 
 
 
947 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.6 
 
 
1068 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.33 
 
 
1082 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.79 
 
 
1060 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  26.23 
 
 
302 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.93 
 
 
1062 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5425  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.29 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6042  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.66 
 
 
451 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.650251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.13 
 
 
1042 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  25.95 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.25 
 
 
1073 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.23 
 
 
1066 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  23.89 
 
 
403 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.07 
 
 
1065 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.18 
 
 
1054 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.88 
 
 
1072 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.52 
 
 
1082 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.72 
 
 
1064 aa  53.9  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  25 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.46 
 
 
1089 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 
1072 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.41 
 
 
1079 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2484  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.42 
 
 
1063 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.32 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000381873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23180  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  29.36 
 
 
1830 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.97809  normal  0.111796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.03 
 
 
1040 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 
1068 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.56 
 
 
1076 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0761  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.44 
 
 
446 aa  52.8  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2728  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.15 
 
 
1077 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.523784  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0560  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 
1079 aa  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2869  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.3 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1370  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.45 
 
 
1095 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3935  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.144651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2535  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 
1072 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.900385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.74 
 
 
1065 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3984  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.43 
 
 
1071 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.66 
 
 
1072 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3737  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3645  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3900  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000425405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0060  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.85 
 
 
1065 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4025  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.48 
 
 
1076 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.16 
 
 
1063 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.37 
 
 
1095 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.56 
 
 
1496 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.83 
 
 
1067 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.73 
 
 
1075 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0593  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 
1074 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.820402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0870  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.56 
 
 
1087 aa  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3022  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.79 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.289298  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.99 
 
 
1072 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.83 
 
 
1076 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2214  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.34 
 
 
1072 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3329  pyruvate carboxylase  23.5 
 
 
1158 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>