147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1278 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  739    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  57.54 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  59.66 
 
 		 357 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  51.97 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  50.56 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  36.05 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  35.29 
 
 		 290 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  24.59 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  26.99 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  24.79 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  24.24 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  31.75 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  23.8 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  29.52 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  24.25 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  23.24 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  26.89 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  25.98 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  25.61 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  27.04 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  23.2 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  27.66 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  23.55 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  25.21 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.43 
 
 		 1030 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.43 
 
 		 1063 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  27.75 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  24.58 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  28.3 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  23.94 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3031  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.58 
 
 		 1084 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144026  decreased coverage  0.0049366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.78 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.86 
 
 		 1059 aa  53.1  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.41 
 
 		 1065 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  23.31 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.87 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22 
 
 		 1064 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.4 
 
 		 1082 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0985  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.86 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.557617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.83 
 
 		 1067 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.67 
 
 		 1106 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.4 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.4 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.3 
 
 		 1038 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.74 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.68 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  23 
 
 		 311 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0560  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.67 
 
 		 1079 aa  48.9  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.65 
 
 		 1042 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.87 
 
 		 1075 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2095  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.45 
 
 		 1162 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.33 
 
 		 1074 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.67 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.21 
 
 		 1056 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.67 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22 
 
 		 938 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.9 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  28.36 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  24.38 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  28 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.66 
 
 		 1065 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2750  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.71 
 
 		 1120 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.11 
 
 		 1096 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.19 
 
 		 1112 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.38 
 
 		 1072 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11413  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1115 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00750159  normal  0.0530566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1703  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.48 
 
 		 1051 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.38 
 
 		 1072 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.57 
 
 		 1081 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  21.72 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.71 
 
 		 1082 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.96 
 
 		 1065 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.56 
 
 		 1105 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.53 
 
 		 1072 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.26 
 
 		 1081 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.68 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0814  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.85 
 
 		 1084 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.253705  normal  0.0427985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1128  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.39 
 
 		 1068 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15590  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.62 
 
 		 1111 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.18 
 
 		 1080 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3018  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23 
 
 		 1074 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 		 1099 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  26 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.51 
 
 		 1083 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.22 
 
 		 1089 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25.41 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.42 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0829  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.51 
 
 		 1112 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.89 
 
 		 1064 aa  44.3  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.66 
 
 		 1062 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  19.85 
 
 		 1060 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1063  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.05 
 
 		 1110 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.68 
 
 		 1082 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3935  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.02 
 
 		 1072 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.144651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3900  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.02 
 
 		 1072 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000425405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.9 
 
 		 1104 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105986  normal  0.458872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>