87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2200 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 		 390 aa  804    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  49.87 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  54.02 
 
 		 457 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  33.51 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  30.56 
 
 		 439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  28.23 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.76 
 
 		 695 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  25.84 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  26.46 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  27.33 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  24.77 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.79 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  27.1 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.32 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  28.02 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  24.64 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.32 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  24.64 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  24.64 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  24.64 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.32 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  24.55 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.65 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  36.89 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.85 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  24.5 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  24.67 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  24.1 
 
 		 513 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  22.41 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  21.97 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  22 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  23.66 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  25.33 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  22.04 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  27.27 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  26.14 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.58 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.73 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  23.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  24.71 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.75 
 
 		 1067 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  25.4 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.08 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.75 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  27.1 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  24.38 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  23.97 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  21.95 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  21.21 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.88 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.17 
 
 		 753 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  25.74 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.69 
 
 		 1066 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.13 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.6 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0534  hypothetical protein  23.57 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1120  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  28.03 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.4 
 
 		 1079 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  22.73 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  22 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  19.94 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.31 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  22.9 
 
 		 349 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  21.93 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  23.25 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.7 
 
 		 1075 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.94 
 
 		 1065 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2524  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.52 
 
 		 1078 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0237548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.96 
 
 		 1081 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  24.18 
 
 		 1165 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.16 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.48 
 
 		 677 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  23.15 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3102  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.66 
 
 		 1100 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  23.75 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.02 
 
 		 1067 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  19.81 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  26.6 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3198  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.64 
 
 		 1130 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00397433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.86 
 
 		 1075 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.86 
 
 		 1077 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.86 
 
 		 1077 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  22.87 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.86 
 
 		 1077 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  21.53 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>