76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2522 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 
322 aa  648    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  40.92 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  35.58 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  34.49 
 
 
327 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.63 
 
 
354 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.34 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  27.34 
 
 
321 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.5 
 
 
312 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  27.1 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.03 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  24.46 
 
 
363 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  24.34 
 
 
322 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  24.68 
 
 
318 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  25.68 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  23.34 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  23.31 
 
 
333 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  28.35 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.13 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.59 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  24.79 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.15 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  22.81 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  24.33 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
677 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  22.09 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.74 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  26.34 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  20.43 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  23.24 
 
 
284 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  22.8 
 
 
404 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  22.92 
 
 
302 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  22.42 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  22.46 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  21.05 
 
 
429 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1847  D-alanyl-alanine synthetase A  26.78 
 
 
328 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00879872  normal  0.0251209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.26 
 
 
399 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.2 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 
891 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  22.47 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  22.36 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.55 
 
 
410 aa  46.2  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  22.56 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  22.89 
 
 
924 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  22.89 
 
 
894 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  22.66 
 
 
926 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.04 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2315  hypothetical protein  22.04 
 
 
397 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  22.66 
 
 
896 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.65 
 
 
422 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  18.85 
 
 
734 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.75 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.65 
 
 
422 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1056  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.26 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  21.67 
 
 
914 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  21.67 
 
 
900 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  21.16 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  20.79 
 
 
425 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  25.79 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  27.22 
 
 
339 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  23.98 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.22 
 
 
904 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1100  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.94 
 
 
442 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0363235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  34.62 
 
 
373 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  27.32 
 
 
376 aa  42.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  28.43 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  23.28 
 
 
346 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  26.09 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.22 
 
 
904 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5946  D-alanyl-alanine synthetase A  37.93 
 
 
329 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.588243  normal  0.0506502 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  28.57 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  27.16 
 
 
383 aa  42.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>