39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2392 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  100 
 
 		 428 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  45.07 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  34.98 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25.44 
 
 		 322 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  26.37 
 
 		 333 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  31.87 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.78 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.09 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.08 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  25.23 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  22.29 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.53 
 
 		 327 aa  67  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.34 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  26.29 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.16 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  24.73 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2998  hypothetical protein  30.19 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.239258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  23.79 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.32 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  25.84 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  23.35 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  27.42 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.42 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.1 
 
 		 336 aa  53.1  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  29.27 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.07 
 
 		 343 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  23.42 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  22.51 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  20.51 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24 
 
 		 354 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  29.31 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  23.45 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  26.72 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  25.32 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  23.44 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  21.52 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  25.63 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  32.84 
 
 		 392 aa  43.1  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>