42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3820 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  100 
 
 		 343 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  39.55 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  40.71 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  33.43 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  32.62 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  30.69 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.34 
 
 		 322 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  28.16 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  34.81 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  33.54 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.81 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  32.54 
 
 		 484 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  29.41 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  28.61 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.35 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  27.03 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  30.17 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.04 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  29.9 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  35 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.62 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  29.18 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 		 677 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.76 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.3 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.84 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.77 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.66 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2688  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.01 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  22.07 
 
 		 428 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  23.91 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.53 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.26 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  23.36 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.48 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  26.26 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11841  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.0751246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  24.88 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  28.5 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  28.41 
 
 		 291 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.09 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.251731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>