166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1774 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  36.57 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  34.62 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.66 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  34.23 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  34.35 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.69 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  31.48 
 
 		 318 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  32.03 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.44 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  29.79 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  31.46 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  30.16 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.5 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.94 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  28.57 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  32.46 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  26.57 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  28.06 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  30.89 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  26.93 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  26.47 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.32 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.74 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.03 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.45 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.99 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.14 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  23.02 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.16 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.16 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  22.15 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  23.23 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  23.05 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  25.41 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.11 
 
 		 1072 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.23 
 
 		 1496 aa  56.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  20.21 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.2 
 
 		 1054 aa  55.8  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  23.02 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.89 
 
 		 1072 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  23.04 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0044  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  23.63 
 
 		 479 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2001  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.48 
 
 		 946 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.890669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.34 
 
 		 1071 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  22.41 
 
 		 429 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.9 
 
 		 1080 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.33 
 
 		 1079 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  25.19 
 
 		 439 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.04 
 
 		 1066 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.51 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0467  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.08 
 
 		 1061 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  25.08 
 
 		 418 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1276  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.45 
 
 		 1081 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  23.08 
 
 		 734 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.78 
 
 		 1081 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2524  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.57 
 
 		 1078 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0237548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.22 
 
 		 1082 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 		 1064 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  24.57 
 
 		 399 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0189  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.89 
 
 		 1085 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.2 
 
 		 1064 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.05 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  21.79 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.85 
 
 		 1062 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.79 
 
 		 1042 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  24.1 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1852  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.75 
 
 		 1072 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3132  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.12 
 
 		 1101 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0872  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.14 
 
 		 1075 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1077 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1077 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1077 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.63 
 
 		 1067 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3296  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.12 
 
 		 1074 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.63 
 
 		 1067 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0069  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1073 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.503132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.41 
 
 		 1105 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.94 
 
 		 1067 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  24.84 
 
 		 426 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1967  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.76 
 
 		 1076 aa  45.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  27.45 
 
 		 753 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0639  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.83 
 
 		 1079 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15590  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.3 
 
 		 1111 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.14 
 
 		 1070 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.49 
 
 		 1073 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0789  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.83 
 
 		 1079 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.51 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0582  Carbamoyl-phosphate synthetase large chain domain protein  22.26 
 
 		 618 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000594141  normal  0.448613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.94 
 
 		 1095 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0173  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  23.51 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004478  carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.1 
 
 		 1077 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.37 
 
 		 1096 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.71 
 
 		 1059 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.47 
 
 		 1059 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.27 
 
 		 894 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.24 
 
 		 924 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>