263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0637 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  936    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  51.29 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  40.65 
 
 
325 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  33.54 
 
 
318 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  32.41 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  37.14 
 
 
322 aa  136  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  37.26 
 
 
333 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  35.13 
 
 
337 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  31.76 
 
 
343 aa  123  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 
327 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.5 
 
 
326 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.39 
 
 
320 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.4 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  31.42 
 
 
361 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  29.67 
 
 
334 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  30.86 
 
 
341 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  38.89 
 
 
291 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 
322 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.35 
 
 
330 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.86 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  28.52 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  25.22 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  23.74 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  23.38 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  23.38 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  24.46 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  23.38 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  31.8 
 
 
363 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.91 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.69 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.65 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
914 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.11 
 
 
900 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  24.75 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.64 
 
 
900 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  22.83 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25 
 
 
1064 aa  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  21.8 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 
677 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  28.97 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.9 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.56 
 
 
324 aa  60.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0342  protein of unknown function DUF201  31.45 
 
 
302 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.89 
 
 
1077 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0836  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.01 
 
 
1106 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  23.4 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  28.17 
 
 
894 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  26.09 
 
 
393 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.17 
 
 
1064 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  27.91 
 
 
896 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.97 
 
 
1099 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.33 
 
 
1059 aa  57.4  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.67 
 
 
1099 aa  57.4  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0191  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.42 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1824  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.42 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.55 
 
 
1070 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.78 
 
 
1059 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.5 
 
 
924 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.15 
 
 
1057 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1819  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.2 
 
 
1107 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1454  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.54 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.15 
 
 
1057 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.15 
 
 
1057 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  23.88 
 
 
429 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.21 
 
 
926 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.65 
 
 
1071 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1265  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.85 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0289407  hitchhiker  0.00381456 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.75 
 
 
1062 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.83 
 
 
1072 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2435  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.17 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 
1071 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.21 
 
 
349 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13841  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.01 
 
 
1102 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.16 
 
 
1075 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.64 
 
 
904 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3645  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.64 
 
 
904 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.86 
 
 
356 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3935  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.144651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3984  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3900  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000425405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.39 
 
 
1067 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3737  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4025  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.15 
 
 
1072 aa  53.5  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0833  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.03 
 
 
1086 aa  53.5  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00324716  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.17 
 
 
1078 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.91 
 
 
1060 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  25.95 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  26.35 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.33 
 
 
912 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2921  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.46 
 
 
450 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1787  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.44 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.77 
 
 
439 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.86 
 
 
395 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62910  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.91 
 
 
1073 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.91 
 
 
1073 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  25.17 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.930196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>