55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3857 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 430 aa  876    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  45.07 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  37.82 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  35.07 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  27.06 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  29.24 
 
 		 337 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  36.43 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  28.51 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.81 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  26.45 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.71 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  28.44 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.2 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.52 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  29.71 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  24.3 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.85 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  26.71 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  23.46 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  22.56 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  26.67 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  27.17 
 
 		 484 aa  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  25.99 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.49 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.56 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.61 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  28.21 
 
 		 332 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  23.9 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  27.36 
 
 		 332 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.65 
 
 		 330 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.48 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  20.96 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.43 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  23.61 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.43 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2998  hypothetical protein  28.48 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.239258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  25.33 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  26.06 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  22.58 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.3 
 
 		 1067 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  25.48 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  21.35 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  23.84 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  23.83 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  18.85 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  22.63 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  23.37 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  24.56 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  31.33 
 
 		 904 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  30.82 
 
 		 894 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.82 
 
 		 924 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  30.82 
 
 		 896 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.82 
 
 		 926 aa  43.5  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>