35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0933 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0801  hypothetical protein  93.37 
 
 		 332 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3693  protein of unknown function DUF201  45.66 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3878  hypothetical protein  41.16 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0188025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3790  hypothetical protein  41.16 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000713822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0661  hypothetical protein  40.51 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.015179  normal  0.248709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1349  ATP-grasp domain protein  40.51 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204009  normal  0.65425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0762  hypothetical protein  34.95 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.960806  normal  0.0752452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0759  hypothetical protein  35.04 
 
 		 391 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.227198 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0081  hypothetical protein  35.74 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0896  hypothetical protein  31.43 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  28.16 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18730  hypothetical protein  29.69 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  29.77 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4985  hypothetical protein  27.69 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.076001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  28.73 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.49 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  26.73 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  28.44 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.51 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.47 
 
 		 1040 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  28.21 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.22 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.7 
 
 		 1074 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.5 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.16 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  38.27 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.45 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.23 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  21 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.17 
 
 		 1042 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  26.9 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  26.9 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1064 aa  43.9  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  30.77 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>